本書的第一篇對南京水利科學研究院發展概況、學科發展歷程、創新平臺、試驗研究基地等進行了總體概括；第二篇按不同研究專業領域，分別對學科發展歷程、主要研究方向與成果、學科發展規劃等進行了系統總結；第三篇對自1978年全國科技大會以來，全院獲得的國家科技進步獎、省部級特等和一等獎等代表性成果進行了詳細介紹；第四篇列出了自建院以來獲得的各類獎勵，出版的專著譯著，取得的授權專利和研發軟件，編寫的標準規范。