本書共分三部分，第一部分為概述，主要介紹圖們江流域概況，內容包括自然地理、氣象水文、經濟社會和生態環境；圖們江水生生物多樣性調查（包括調查原則、調查方法、流程和主要結果）。第二部分主要展示圖們江常見水生生物的圖鑒及分類特征，內容涵蓋藻類、大型底棲動物、魚類、兩棲動物、爬行動物和大型植物。第三部分為附錄，提供了物種的名錄與分布。
本書適合流域水生態監測與評價、流域水生生物多樣性保護、流域漁業資源養護等相關領域的科研和管理人員參考閱讀。