自全國部分地區發生非典疫情以來，社黨委高度重視，研究確定了“一手抓預防非典，一手抓生產經營”的指導思想，并采取積極措施確保預防非典和出版工作“兩不誤”、“雙勝利”。
　　第一、統一思想，提高認識。社黨委多次召開黨委會議和黨支部書記會議，學習中央和水利部黨組的有關精神，分析疫情特點和發展趨勢，及時研究和調整預防措施；專門下發了《關于做好防治“非典”工作的通知》，要求各單位部門、群眾組織和全社職工高度重視，把思想統一到中央的有關精神上來。社還通過網絡、宣傳欄等形式，宣傳防治“非典”工作的相關動態，宣傳預防知識，提醒職工注意辦公場所、家庭和個人衛生。社黨委還要求充分發揮黨支部的戰斗堡壘作用和黨員的先鋒模范作用，為取得抗擊非典的最后勝利作出貢獻；要求全社職工做到不信謠，不傳謠，增強抗擊非典的必勝信心。
　　第二、加強領導，成立機構。社黨委研究決定，成立由社領導牽頭，黨辦、工會、服務中心等部門負責人參加的防治“非典”工作機構，并安排了具體人員擔任聯絡員，保持全天24小時聯系暢通。獨立單位也指定一位領導干部具體負責防治工作。我社形成了黨委牽頭、黨政工團齊抓共管、全社職工積極參與的預防“非典”的工作格局。
　　第三、突出重點，加強預防。為解決上下班乘公交車人多易感染的問題，社領導決定將上班時間由上午8時改為9時。為做好流動人員的防護管理，社辦公室對全社聘任人員、臨時人員，尤其是外地來京人員，進行了重新登記，并妥善做好安置工作，避免向外地流動。社辦公室十分關心離退休職工的身體健康，建立了健康報告制度，每天上午對離退休職工的健康狀況進行詢問統計。社里也加強了公共場所的衛生、通風和消毒工作，為職工購置了紗布口罩、預防藥物、消毒藥品和指導用書，并給職工注射了胸腺肽針劑。傳達室專門加設一道崗，以加強對進社人員的盤查，制止有相關癥狀者和無關人員的進入。服務中心還提前做好滅蚊蠅和空調機的清洗和消毒工作。工會組織還專門召開會議，布置預防“非典”工作。
　　第四、捐款贈物，做好服務。社黨委向在抗擊“非典”第一線的職工家屬（醫護工作者）發放了慰問信，鼓勵他們為抗擊“非典”作出更大的貢獻，并向他們贈送了慰問金和預防藥物。社有關部門還組織開展了向醫護工作者、兄弟省市疫區的捐款活動，總計捐款逾萬元。
　　第五、因時制宜，促進發展。為了保證正常工作的開展，社黨委要求各單位、部門對工作進行適當調整，暫停或減免到外地出差。編輯、出版、發行和職能等部門均利用現代的網絡技術、通信技術開展工作，確保工作流程暢通無阻，確保中心工作不受影響。充分調動地方發行站、書店的作用，做好圖書發行工作。社黨委強調，預防非典工作是重點，生產經營是中心，兩者只能加強，不能放松。還要求社內有關單位、部門利用這一時期做好召開職工代表大會和開展精神文明單位創建活動的工作，以深化和鞏固新一輪改革的成果，全面推進出版的改革和發展。